А домены привязаны или чисто на ip? Возможно с ними не повезло. Я бы ещё попробовал посмотреть нагрузку на процессор, возможно там тоже есть проблемы, несколько раз ставил 3xui, который бестолково грузил на 100 процентов даже без настроенных инбаундов.

Не исключаю, что проблемы с новым сервером могли прийти с прошлым доменом. Если есть возможность, взять другой сервер и потестить без домена.